參與廢水生物處理的生物種類有很多，主要是以下幾種：

1、細菌類：在污水處理所利用的生物群中，細菌是體形最微小的一種。它具有在好氧及厭氧條件下分解吸收各種有機物的能力。對污水生物處理起作用的有菌膠團、球衣細菌、硝化菌、脫氮菌、聚磷菌等幾種。

菌膠團：在活性污泥法、生物膜法等幾乎所有好氧生物處理中。它是形成生物絮體和生物膜的主要生物，在膠質中含有無數的菌體。菌膠團為異養菌。

球衣細菌：菌體排成一列呈絲狀，通常為白色或灰色，是最常見的一類菌種。在活性污泥中大量繁殖，會使活性污泥膨脹，給污水處理帶來危害。球衣細菌為異養菌。

硝化菌：在好氧條件下，將氨氮氧華為亞硝酸鹽，將亞硝酸鹽氧化為硝酸鹽的細菌。硝化菌為自養菌。

脫氮菌：在缺氧條件下（無溶解氧），能利用硝酸鹽中的氧（結合氧）來氧化分解有機物，將亞硝酸鹽或硝酸鹽還原為氮氣。硝化菌為異養菌。

聚磷菌：在厭氧（無溶解氧、無硝酸鹽和亞硝酸鹽）和好氧交替條件下，對磷有過剩的攝取能力。聚磷菌為異養菌。

2、原生動物：原生動物具有吞食污水中的有機物、細菌，在體內迅速氧化分解的能力，因此，在活性污泥法和生物膜法中，它除了能除去有機物，加快有機物的分解速度外，還能使生物膜的表面吸附能力獲得再生。原生動物是單細胞的好氧性生物。

3、藻類：藻類是植物，含有葉綠素。當葉綠素吸收二氧化碳和水進行光合作用而生成碳水化合物時，將放出大量的氧氣于水中。穩定塘就是利用這種氧來氧化污水中的有機物。

4、后生動物：以上所介紹的生物都是單細胞構成的生物圖，而后生動物稍復雜，由于多細胞構成，體內還有各種器官。參與污水處理的后生動物，包括從體形較小的輪蟲到棲息于生物濾池的甲殼蟲、昆蟲幼蟲等體形較大的類型。